Wciąż rozbudowująca się Huta oraz osiedla mieszkaniowe w nowej dzielnicy powodowały coraz większe zapotrzebowanie na pojazdy komunikacji miejskiej. W grudniu 1963 roku do Krakowa trafiają pierwsze sztuki autobusów Jelcz 272MEX, które zaczęły zastępować wysłużone Sany. W związku z ograniczeniami powierzchni w dawnych halach zajezdni tramwajowej i coraz większą ilością pojazdów zdecydowano się na adaptację opuszczonego hangaru i fragmentu placu po lotnisku Rakowice. Miało to być rozwiązanie tymczasowe do momentu wybudowania nowej zajezdni. Baza na terenie lotniska po dostosowaniu do obsługi autobusów uruchomiona została w grudniu 1968r. Dwa lata wcześniej, w kwietniu 1966r. rozpoczęto budowę nowej zajezdni zlokalizowanej przy ul. Makuszyńskiego. Zajezdnia ta w przyszłości otrzymała nazwę Bieńczyce. Uroczyste uruchomienie zajezdni nastąpiło w poniedziałek 15 czerwca 1970 roku. Zakład wybudowany przy ul. Makuszyńskiego był pierwszym odpowiadającym standardom komunikacji miejskiej. Przygotowany na 150 pojazdów, miał przejąć większość pracy za zajezdnię w Czyżynach, z czasem doprowadzając ją do zamknięcia (paradoksem jest fakt, że tymczasowa w założeniu zajezdnia Czyżyny funkcjonowała aż do 1998r.). W dniu 13 czerwca 2015 roku w związku z 45-leciem uruchomienia zajezdni Bieńczyce zorganizowano dzień otwarty, podczas którego można było poznać historię nowohuckiej zajezdni dzięki zaprezentowanej kronice, oglądnąć zdjęcia oraz modele w skali 1:87 a także zwiedzić obiekty wchodzące w skład całego obiektu. Zaprezentowano część historycznej floty MPK, tj. autobusy Autosan H6-06, Ikarus 280.26 czy Jelcz 272MEX oraz aktualnie eksploatowane pojazdy w tym najnowszy nabytek zajezdni Bieńczyce, hybrydowego Solarisa Urbino 18. Specjalnym autobusem można było również udać się w przejazd po terenie zajezdni.